A Magyar Tudományos Akadémia 2011. december 5-i közgyűlésén nagy többséggel elfogadott határozatok értelmében - a kiválóság, a versenyképesség és a fenntarthatóság elvének érvényesítésével - a kutatóintézet-hálózat megújítása során a korábbi 38 kutatóintézetből és 2 kutatóközpontból január 1-jétől 10 kutatóközpont és 5 kutatóintézet alakult meg, amelyek főigazgatói egy évre kaptak megbízást.

Az MTA Agrártudományi Kutatóközpont megbízott főigazgatója Bedő Zoltán, az MTA Bölcsészettudományi Kutatóközponté Fodor Pál, az MTA Csillagászati és Földtudományi Kutatóközponté Ábrahám Péter, az MTA Energiatudományi Kutatóközponté Gadó János, az MTA Közgazdaság- és Regionális Tudományi Kutatóközponté Fazekas Károly, az MTA Ökológiai Kutatóközponté Báldi András, az MTA Társadalomtudományi Kutatóközponté Körösényi András, az MTA Természettudományi Kutatóközponté Szépvölgyi János, az MTA Wigner Fizikai Kutatóközpont Lévai Péter lett.

Változatlan formában működik tovább az MTA Atommagkutató Intézet (főigazgató: Fülöp Zsolt), az MTA Kísérleti Orvostudományi Kutatóintézet (főigazgató: Freund Tamás), az MTA Nyelvtudományi Intézet (főigazgató: Kenesei István), az MTA Rényi Alfréd Matematikai Kutatóintézet (főigazgató: Pálfy Péter Pál), az MTA Számítástechnikai és Automatizálási Kutatóintézet (főigazgató: Inzelt Péter) és az MTA Szegedi Biológiai Kutatóközpont (főigazgató: Ormos Pál).